Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpv1Q704Y3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpv1Q704Y3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpv1Q704Y3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpv1Q704Y3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trpv1Q704Y3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpv1Q704Y3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpv1Q704Y3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpv1Q704Y3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpv1Q704Y3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpv1Q704Y3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpv1Q704Y3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpv1Q704Y3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpv1Q704Y3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpv1Q704Y3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpv1Q704Y3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpv1Q704Y3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trpv1Q704Y3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trpv1Q704Y3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpv1Q704Y3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trpv1Q704Y3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trpv1Q704Y3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpv1Q704Y3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpv1Q704Y3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpv1Q704Y3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpv1Q704Y3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpv1Q704Y3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpv1Q704Y3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpv1Q704Y3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trpv1Q704Y3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpv1Q704Y3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpv1Q704Y3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms