Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl35Q6ZWV7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpl35Q6ZWV7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpl35Q6ZWV7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl35Q6ZWV7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl35Q6ZWV7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl35Q6ZWV7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl35Q6ZWV7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms