Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nup188Q6ZQH8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nup188Q6ZQH8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nup188Q6ZQH8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup188Q6ZQH8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nup188Q6ZQH8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup188Q6ZQH8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup188Q6ZQH8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup188Q6ZQH8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup188Q6ZQH8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup188Q6ZQH8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup188Q6ZQH8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup188Q6ZQH8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup188Q6ZQH8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup188Q6ZQH8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup188Q6ZQH8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup188Q6ZQH8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup188Q6ZQH8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup188Q6ZQH8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup188Q6ZQH8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup188Q6ZQH8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup188Q6ZQH8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nup188Q6ZQH8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nup188Q6ZQH8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nup188Q6ZQH8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Nup188Q6ZQH8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms