Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Larp1Q6ZQ58 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Larp1Q6ZQ58 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Larp1Q6ZQ58 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Larp1Q6ZQ58 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Larp1Q6ZQ58 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Larp1Q6ZQ58 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Larp1Q6ZQ58 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Larp1Q6ZQ58 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Larp1Q6ZQ58 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Larp1Q6ZQ58 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Larp1Q6ZQ58 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Larp1Q6ZQ58 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Larp1Q6ZQ58 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Larp1Q6ZQ58 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Larp1Q6ZQ58 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Larp1Q6ZQ58 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Larp1Q6ZQ58 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Larp1Q6ZQ58 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Larp1Q6ZQ58 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Larp1Q6ZQ58 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Larp1Q6ZQ58 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Larp1Q6ZQ58 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Larp1Q6ZQ58 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Larp1Q6ZQ58 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Larp1Q6ZQ58 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Larp1Q6ZQ58 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Larp1Q6ZQ58 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Larp1Q6ZQ58 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Larp1Q6ZQ58 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Larp1Q6ZQ58 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Larp1Q6ZQ58 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Larp1Q6ZQ58 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms