Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scgb2b2Q6UGQ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scgb2b2Q6UGQ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scgb2b2Q6UGQ3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms