Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Atp2b4Q6Q477 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Atp2b4Q6Q477 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Atp2b4Q6Q477 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Atp2b4Q6Q477 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Atp2b4Q6Q477 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Atp2b4Q6Q477 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Atp2b4Q6Q477 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Atp2b4Q6Q477 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Atp2b4Q6Q477 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Atp2b4Q6Q477 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Atp2b4Q6Q477 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Atp2b4Q6Q477 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Atp2b4Q6Q477 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Atp2b4Q6Q477 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Atp2b4Q6Q477 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Atp2b4Q6Q477 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Atp2b4Q6Q477 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Atp2b4Q6Q477 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Atp2b4Q6Q477 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Atp2b4Q6Q477 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Atp2b4Q6Q477 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Atp2b4Q6Q477 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Atp2b4Q6Q477 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Atp2b4Q6Q477 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Atp2b4Q6Q477 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Atp2b4Q6Q477 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
Atp2b4Q6Q477 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Atp2b4Q6Q477 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Atp2b4Q6Q477 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Atp2b4Q6Q477 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Atp2b4Q6Q477 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Atp2b4Q6Q477 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Atp2b4Q6Q477 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Atp2b4Q6Q477 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Atp2b4Q6Q477 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Atp2b4Q6Q477 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Atp2b4Q6Q477 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Atp2b4Q6Q477 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Atp2b4Q6Q477 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Atp2b4Q6Q477 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Atp2b4Q6Q477 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Atp2b4Q6Q477 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Atp2b4Q6Q477 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Atp2b4Q6Q477 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Atp2b4Q6Q477 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Atp2b4Q6Q477 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Atp2b4Q6Q477 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Atp2b4Q6Q477 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Atp2b4Q6Q477 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Atp2b4Q6Q477 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Atp2b4Q6Q477 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44,9 ms