Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna2d2Q6PHS9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna2d2Q6PHS9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna2d2Q6PHS9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna2d2Q6PHS9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna2d2Q6PHS9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna2d2Q6PHS9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna2d2Q6PHS9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d2Q6PHS9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna2d2Q6PHS9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna2d2Q6PHS9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna2d2Q6PHS9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna2d2Q6PHS9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna2d2Q6PHS9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna2d2Q6PHS9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna2d2Q6PHS9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms