Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Bms1Q6PGF5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bms1Q6PGF5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bms1Q6PGF5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bms1Q6PGF5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bms1Q6PGF5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Bms1Q6PGF5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Bms1Q6PGF5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Bms1Q6PGF5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Bms1Q6PGF5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Bms1Q6PGF5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bms1Q6PGF5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bms1Q6PGF5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bms1Q6PGF5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Bms1Q6PGF5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Bms1Q6PGF5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Bms1Q6PGF5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Bms1Q6PGF5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Bms1Q6PGF5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Bms1Q6PGF5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Bms1Q6PGF5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bms1Q6PGF5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Bms1Q6PGF5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Bms1Q6PGF5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Bms1Q6PGF5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Bms1Q6PGF5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Bms1Q6PGF5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Bms1Q6PGF5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Bms1Q6PGF5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Bms1Q6PGF5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Bms1Q6PGF5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Bms1Q6PGF5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Bms1Q6PGF5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bms1Q6PGF5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Bms1Q6PGF5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms