Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Med16Q6PGF3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Med16Q6PGF3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Med16Q6PGF3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Med16Q6PGF3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Med16Q6PGF3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Med16Q6PGF3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Med16Q6PGF3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Med16Q6PGF3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Med16Q6PGF3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Med16Q6PGF3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Med16Q6PGF3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Med16Q6PGF3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Med16Q6PGF3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Med16Q6PGF3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Med16Q6PGF3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Med16Q6PGF3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms