Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc85bQ6PDY0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85bQ6PDY0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85bQ6PDY0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85bQ6PDY0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85bQ6PDY0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc85bQ6PDY0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc85bQ6PDY0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc85bQ6PDY0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc85bQ6PDY0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc85bQ6PDY0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85bQ6PDY0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85bQ6PDY0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85bQ6PDY0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85bQ6PDY0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc85bQ6PDY0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc85bQ6PDY0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85bQ6PDY0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc85bQ6PDY0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc85bQ6PDY0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc85bQ6PDY0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms