Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dtx4Q6PDK8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dtx4Q6PDK8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dtx4Q6PDK8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dtx4Q6PDK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms