Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BC061212Q6P8K3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BC061212Q6P8K3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BC061212Q6P8K3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms