Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frg2f1Q6P3A2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frg2f1Q6P3A2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frg2f1Q6P3A2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frg2f1Q6P3A2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frg2f1Q6P3A2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frg2f1Q6P3A2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frg2f1Q6P3A2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frg2f1Q6P3A2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Frg2f1Q6P3A2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frg2f1Q6P3A2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Frg2f1Q6P3A2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Frg2f1Q6P3A2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Frg2f1Q6P3A2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frg2f1Q6P3A2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frg2f1Q6P3A2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Frg2f1Q6P3A2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frg2f1Q6P3A2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frg2f1Q6P3A2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Frg2f1Q6P3A2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Frg2f1Q6P3A2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms