Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E1

Zmiz1, Zinc finger MIZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmiz1Q6P1E1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zmiz1Q6P1E1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zmiz1Q6P1E1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zmiz1Q6P1E1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zmiz1Q6P1E1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zmiz1Q6P1E1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zmiz1Q6P1E1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zmiz1Q6P1E1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zmiz1Q6P1E1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms