Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sec23ipQ6NZC7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sec23ipQ6NZC7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sec23ipQ6NZC7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sec23ipQ6NZC7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sec23ipQ6NZC7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sec23ipQ6NZC7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec23ipQ6NZC7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec23ipQ6NZC7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sec23ipQ6NZC7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec23ipQ6NZC7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sec23ipQ6NZC7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sec23ipQ6NZC7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sec23ipQ6NZC7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sec23ipQ6NZC7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sec23ipQ6NZC7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23ipQ6NZC7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sec23ipQ6NZC7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms