Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Frem2Q6NVD0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Frem2Q6NVD0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Frem2Q6NVD0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Frem2Q6NVD0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frem2Q6NVD0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frem2Q6NVD0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frem2Q6NVD0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frem2Q6NVD0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frem2Q6NVD0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frem2Q6NVD0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frem2Q6NVD0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frem2Q6NVD0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frem2Q6NVD0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frem2Q6NVD0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frem2Q6NVD0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Frem2Q6NVD0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frem2Q6NVD0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frem2Q6NVD0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms