Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Carmil1Q6EDY6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Carmil1Q6EDY6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Carmil1Q6EDY6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Carmil1Q6EDY6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Carmil1Q6EDY6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Carmil1Q6EDY6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Carmil1Q6EDY6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Carmil1Q6EDY6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Carmil1Q6EDY6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Carmil1Q6EDY6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Carmil1Q6EDY6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Carmil1Q6EDY6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Carmil1Q6EDY6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Carmil1Q6EDY6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Carmil1Q6EDY6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Carmil1Q6EDY6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Carmil1Q6EDY6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
Carmil1Q6EDY6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Carmil1Q6EDY6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Carmil1Q6EDY6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Carmil1Q6EDY6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Carmil1Q6EDY6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Carmil1Q6EDY6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Carmil1Q6EDY6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Carmil1Q6EDY6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Carmil1Q6EDY6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Carmil1Q6EDY6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Carmil1Q6EDY6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Carmil1Q6EDY6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Carmil1Q6EDY6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Carmil1Q6EDY6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Carmil1Q6EDY6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Carmil1Q6EDY6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
Carmil1Q6EDY6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Carmil1Q6EDY6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Carmil1Q6EDY6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Carmil1Q6EDY6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Carmil1Q6EDY6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Carmil1Q6EDY6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Carmil1Q6EDY6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Carmil1Q6EDY6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Carmil1Q6EDY6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Carmil1Q6EDY6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Carmil1Q6EDY6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Carmil1Q6EDY6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Carmil1Q6EDY6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Carmil1Q6EDY6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Carmil1Q6EDY6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms