Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep290Q6A078 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep290Q6A078 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep290Q6A078 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep290Q6A078 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep290Q6A078 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cep290Q6A078 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep290Q6A078 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep290Q6A078 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep290Q6A078 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep290Q6A078 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep290Q6A078 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep290Q6A078 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep290Q6A078 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep290Q6A078 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep290Q6A078 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep290Q6A078 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cep290Q6A078 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep290Q6A078 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cep290Q6A078 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep290Q6A078 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep290Q6A078 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep290Q6A078 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep290Q6A078 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep290Q6A078 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep290Q6A078 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep290Q6A078 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep290Q6A078 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep290Q6A078 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep290Q6A078 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep290Q6A078 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep290Q6A078 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep290Q6A078 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep290Q6A078 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep290Q6A078 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep290Q6A078 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep290Q6A078 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep290Q6A078 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep290Q6A078 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep290Q6A078 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep290Q6A078 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep290Q6A078 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep290Q6A078 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep290Q6A078 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep290Q6A078 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep290Q6A078 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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