Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cep170Q6A065 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cep170Q6A065 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cep170Q6A065 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cep170Q6A065 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cep170Q6A065 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Cep170Q6A065 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Cep170Q6A065 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Cep170Q6A065 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Cep170Q6A065 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cep170Q6A065 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cep170Q6A065 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cep170Q6A065 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Cep170Q6A065 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cep170Q6A065 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cep170Q6A065 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cep170Q6A065 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Cep170Q6A065 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cep170Q6A065 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cep170Q6A065 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Cep170Q6A065 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cep170Q6A065 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cep170Q6A065 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cep170Q6A065 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Cep170Q6A065 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Cep170Q6A065 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cep170Q6A065 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Cep170Q6A065 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Cep170Q6A065 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Cep170Q6A065 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Cep170Q6A065 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Cep170Q6A065 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Cep170Q6A065 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cep170Q6A065 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cep170Q6A065 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Cep170Q6A065 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cep170Q6A065 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cep170Q6A065 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Cep170Q6A065 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Cep170Q6A065 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Cep170Q6A065 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Cep170Q6A065 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Cep170Q6A065 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Cep170Q6A065 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Cep170Q6A065 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Cep170Q6A065 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Cep170Q6A065 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.62
Cep170Q6A065 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Cep170Q6A065 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Cep170Q6A065 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Cep170Q6A065 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Cep170Q6A065 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Cep170Q6A065 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Cep170Q6A065 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Cep170Q6A065 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Cep170Q6A065 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Cep170Q6A065 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Cep170Q6A065 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cep170Q6A065 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cep170Q6A065 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cep170Q6A065 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cep170Q6A065 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms