Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntn4Q69Z26 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntn4Q69Z26 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntn4Q69Z26 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntn4Q69Z26 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntn4Q69Z26 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntn4Q69Z26 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cntn4Q69Z26 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cntn4Q69Z26 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntn4Q69Z26 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn4Q69Z26 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntn4Q69Z26 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms