Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VclQ64727 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VclQ64727 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VclQ64727 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VclQ64727 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VclQ64727 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VclQ64727 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VclQ64727 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VclQ64727 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VclQ64727 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VclQ64727 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VclQ64727 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VclQ64727 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VclQ64727 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VclQ64727 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VclQ64727 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VclQ64727 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VclQ64727 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VclQ64727 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VclQ64727 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VclQ64727 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VclQ64727 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VclQ64727 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VclQ64727 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VclQ64727 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VclQ64727 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VclQ64727 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VclQ64727 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VclQ64727 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VclQ64727 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VclQ64727 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VclQ64727 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VclQ64727 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VclQ64727 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VclQ64727 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VclQ64727 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VclQ64727 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VclQ64727 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VclQ64727 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VclQ64727 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VclQ64727 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VclQ64727 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VclQ64727 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VclQ64727 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VclQ64727 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VclQ64727 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VclQ64727 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VclQ64727 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VclQ64727 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VclQ64727 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VclQ64727 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VclQ64727 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VclQ64727 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VclQ64727 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VclQ64727 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VclQ64727 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VclQ64727 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VclQ64727 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VclQ64727 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VclQ64727 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VclQ64727 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VclQ64727 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VclQ64727 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VclQ64727 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VclQ64727 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VclQ64727 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VclQ64727 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VclQ64727 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VclQ64727 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VclQ64727 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VclQ64727 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VclQ64727 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VclQ64727 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VclQ64727 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VclQ64727 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VclQ64727 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VclQ64727 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VclQ64727 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VclQ64727 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VclQ64727 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VclQ64727 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VclQ64727 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VclQ64727 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VclQ64727 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VclQ64727 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VclQ64727 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VclQ64727 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VclQ64727 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VclQ64727 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VclQ64727 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VclQ64727 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VclQ64727 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VclQ64727 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VclQ64727 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VclQ64727 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VclQ64727 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VclQ64727 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VclQ64727 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VclQ64727 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VclQ64727 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms