Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hist2h2beQ64524 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hist2h2beQ64524 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms