Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn13Q64512 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptpn13Q64512 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ptpn13Q64512 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptpn13Q64512 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptpn13Q64512 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms