Protein–RNA interactions for Protein: Q641K1

Agtpbp1, Cytosolic carboxypeptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agtpbp1Q641K1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Agtpbp1Q641K1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Agtpbp1Q641K1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Agtpbp1Q641K1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Agtpbp1Q641K1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Agtpbp1Q641K1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Agtpbp1Q641K1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Agtpbp1Q641K1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Agtpbp1Q641K1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Agtpbp1Q641K1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Agtpbp1Q641K1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Agtpbp1Q641K1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Agtpbp1Q641K1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Agtpbp1Q641K1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Agtpbp1Q641K1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Agtpbp1Q641K1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Agtpbp1Q641K1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Agtpbp1Q641K1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Agtpbp1Q641K1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Agtpbp1Q641K1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Agtpbp1Q641K1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Agtpbp1Q641K1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Agtpbp1Q641K1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Agtpbp1Q641K1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Agtpbp1Q641K1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Agtpbp1Q641K1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Agtpbp1Q641K1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Agtpbp1Q641K1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Agtpbp1Q641K1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Agtpbp1Q641K1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Agtpbp1Q641K1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Agtpbp1Q641K1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Agtpbp1Q641K1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Agtpbp1Q641K1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Agtpbp1Q641K1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Agtpbp1Q641K1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Agtpbp1Q641K1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Agtpbp1Q641K1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Agtpbp1Q641K1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Agtpbp1Q641K1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Agtpbp1Q641K1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Agtpbp1Q641K1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Agtpbp1Q641K1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Agtpbp1Q641K1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Agtpbp1Q641K1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Agtpbp1Q641K1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Agtpbp1Q641K1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Agtpbp1Q641K1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Agtpbp1Q641K1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Agtpbp1Q641K1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms