Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vamp1Q62442 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp1Q62442 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp1Q62442 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vamp1Q62442 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp1Q62442 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms