Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha6Q62413 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Epha6Q62413 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha6Q62413 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha6Q62413 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha6Q62413 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha6Q62413 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha6Q62413 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha6Q62413 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha6Q62413 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha6Q62413 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha6Q62413 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Epha6Q62413 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Epha6Q62413 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Epha6Q62413 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms