Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sycp1Q62209 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sycp1Q62209 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sycp1Q62209 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sycp1Q62209 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp1Q62209 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sycp1Q62209 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sycp1Q62209 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sycp1Q62209 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sycp1Q62209 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp1Q62209 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sycp1Q62209 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sycp1Q62209 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sycp1Q62209 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp1Q62209 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms