Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SelplgQ62170 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelplgQ62170 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SelplgQ62170 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SelplgQ62170 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.6 ms