Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Itga6Q61739 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Itga6Q61739 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Itga6Q61739 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Itga6Q61739 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Itga6Q61739 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Itga6Q61739 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Itga6Q61739 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Itga6Q61739 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Itga6Q61739 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Itga6Q61739 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Itga6Q61739 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Itga6Q61739 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Itga6Q61739 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Itga6Q61739 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Itga6Q61739 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Itga6Q61739 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Itga6Q61739 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Itga6Q61739 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Itga6Q61739 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Itga6Q61739 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Itga6Q61739 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Itga6Q61739 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Itga6Q61739 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Itga6Q61739 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Itga6Q61739 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Itga6Q61739 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Itga6Q61739 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Itga6Q61739 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Itga6Q61739 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Itga6Q61739 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Itga6Q61739 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Itga6Q61739 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Itga6Q61739 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Itga6Q61739 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Itga6Q61739 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Itga6Q61739 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Itga6Q61739 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Itga6Q61739 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Itga6Q61739 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Itga6Q61739 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Itga6Q61739 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms