Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2f1Q61501 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
E2f1Q61501 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f1Q61501 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
E2f1Q61501 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
E2f1Q61501 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E2f1Q61501 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms