Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MslnQ61468 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MslnQ61468 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MslnQ61468 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MslnQ61468 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MslnQ61468 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MslnQ61468 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MslnQ61468 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MslnQ61468 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MslnQ61468 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MslnQ61468 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MslnQ61468 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MslnQ61468 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MslnQ61468 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MslnQ61468 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MslnQ61468 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140 ms