Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pde3bQ61409 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde3bQ61409 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde3bQ61409 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pde3bQ61409 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pde3bQ61409 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pde3bQ61409 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pde3bQ61409 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pde3bQ61409 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pde3bQ61409 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pde3bQ61409 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pde3bQ61409 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde3bQ61409 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde3bQ61409 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde3bQ61409 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pde3bQ61409 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pde3bQ61409 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pde3bQ61409 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pde3bQ61409 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pde3bQ61409 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pde3bQ61409 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pde3bQ61409 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pde3bQ61409 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Pde3bQ61409 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde3bQ61409 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms