Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tsg101Q61187 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tsg101Q61187 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tsg101Q61187 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Tsg101Q61187 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tsg101Q61187 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms