Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gbp4Q61107 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp4Q61107 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp4Q61107 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp4Q61107 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp4Q61107 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp4Q61107 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp4Q61107 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp4Q61107 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp4Q61107 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp4Q61107 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp4Q61107 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp4Q61107 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp4Q61107 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp4Q61107 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp4Q61107 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp4Q61107 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms