Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HellsQ60848 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HellsQ60848 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HellsQ60848 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HellsQ60848 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HellsQ60848 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HellsQ60848 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HellsQ60848 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HellsQ60848 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HellsQ60848 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HellsQ60848 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HellsQ60848 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HellsQ60848 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HellsQ60848 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HellsQ60848 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HellsQ60848 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HellsQ60848 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HellsQ60848 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HellsQ60848 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HellsQ60848 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HellsQ60848 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HellsQ60848 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HellsQ60848 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HellsQ60848 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HellsQ60848 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HellsQ60848 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HellsQ60848 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HellsQ60848 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HellsQ60848 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HellsQ60848 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HellsQ60848 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HellsQ60848 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HellsQ60848 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HellsQ60848 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HellsQ60848 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HellsQ60848 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HellsQ60848 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HellsQ60848 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HellsQ60848 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HellsQ60848 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HellsQ60848 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HellsQ60848 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HellsQ60848 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HellsQ60848 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HellsQ60848 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HellsQ60848 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HellsQ60848 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HellsQ60848 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HellsQ60848 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HellsQ60848 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HellsQ60848 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HellsQ60848 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HellsQ60848 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HellsQ60848 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HellsQ60848 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HellsQ60848 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HellsQ60848 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HellsQ60848 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HellsQ60848 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HellsQ60848 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HellsQ60848 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HellsQ60848 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HellsQ60848 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HellsQ60848 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HellsQ60848 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HellsQ60848 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HellsQ60848 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
HellsQ60848 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HellsQ60848 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HellsQ60848 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HellsQ60848 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HellsQ60848 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HellsQ60848 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HellsQ60848 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HellsQ60848 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HellsQ60848 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HellsQ60848 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HellsQ60848 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HellsQ60848 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HellsQ60848 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HellsQ60848 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HellsQ60848 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HellsQ60848 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HellsQ60848 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HellsQ60848 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HellsQ60848 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HellsQ60848 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms