Protein–RNA interactions for Protein: Q60716

P4ha2, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha2Q60716 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P4ha2Q60716 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P4ha2Q60716 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha2Q60716 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P4ha2Q60716 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22■■□□□ 1.11
P4ha2Q60716 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P4ha2Q60716 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha2Q60716 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P4ha2Q60716 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P4ha2Q60716 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha2Q60716 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha2Q60716 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha2Q60716 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha2Q60716 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
P4ha2Q60716 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P4ha2Q60716 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P4ha2Q60716 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P4ha2Q60716 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P4ha2Q60716 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P4ha2Q60716 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P4ha2Q60716 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P4ha2Q60716 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms