Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PmelQ60696 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PmelQ60696 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PmelQ60696 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PmelQ60696 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PmelQ60696 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PmelQ60696 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PmelQ60696 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PmelQ60696 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PmelQ60696 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PmelQ60696 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PmelQ60696 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PmelQ60696 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmelQ60696 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmelQ60696 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PmelQ60696 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PmelQ60696 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmelQ60696 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmelQ60696 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmelQ60696 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PmelQ60696 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PmelQ60696 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PmelQ60696 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmelQ60696 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmelQ60696 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmelQ60696 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PmelQ60696 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmelQ60696 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PmelQ60696 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PmelQ60696 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PmelQ60696 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PmelQ60696 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PmelQ60696 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PmelQ60696 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PmelQ60696 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PmelQ60696 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PmelQ60696 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PmelQ60696 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PmelQ60696 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PmelQ60696 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmelQ60696 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PmelQ60696 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PmelQ60696 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms