Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb6Q60692 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmb6Q60692 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb6Q60692 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb6Q60692 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms