Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprnQ60673 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprnQ60673 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprnQ60673 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprnQ60673 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprnQ60673 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprnQ60673 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprnQ60673 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprnQ60673 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprnQ60673 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprnQ60673 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprnQ60673 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprnQ60673 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprnQ60673 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprnQ60673 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprnQ60673 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprnQ60673 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprnQ60673 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprnQ60673 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprnQ60673 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprnQ60673 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprnQ60673 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprnQ60673 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprnQ60673 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprnQ60673 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprnQ60673 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprnQ60673 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprnQ60673 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms