Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
PtprnQ60673 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
PtprnQ60673 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
PtprnQ60673 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
PtprnQ60673 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23,45■■□□□ 1,34
PtprnQ60673 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
PtprnQ60673 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
PtprnQ60673 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
PtprnQ60673 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
PtprnQ60673 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
PtprnQ60673 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
PtprnQ60673 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
PtprnQ60673 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
PtprnQ60673 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
PtprnQ60673 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
PtprnQ60673 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
PtprnQ60673 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23,38■■□□□ 1,33
PtprnQ60673 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23,37■■□□□ 1,33
PtprnQ60673 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
PtprnQ60673 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
PtprnQ60673 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23,36■■□□□ 1,33
PtprnQ60673 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
PtprnQ60673 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
PtprnQ60673 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
PtprnQ60673 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
PtprnQ60673 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23,28■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,27■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23,27■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
PtprnQ60673 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23,23■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23,22■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23,22■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23,22■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23,21■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
PtprnQ60673 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23,19■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23,16■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
PtprnQ60673 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,14■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23,14■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,13■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23,11■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23,1■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23,1■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
PtprnQ60673 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
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