Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC31,09■■■□□ 2,57
Sik1Q60670 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Sik1Q60670 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31,08■■■□□ 2,57
Sik1Q60670 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC31,06■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Sik1Q60670 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31,01■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Sik1Q60670 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Sik1Q60670 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Sik1Q60670 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Sik1Q60670 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Sik1Q60670 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Sik1Q60670 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Sik1Q60670 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
Sik1Q60670 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Sik1Q60670 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Sik1Q60670 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Sik1Q60670 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Sik1Q60670 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Sik1Q60670 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30,89■■■□□ 2,54
Sik1Q60670 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Sik1Q60670 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Sik1Q60670 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30,87■■■□□ 2,53
Sik1Q60670 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Sik1Q60670 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Sik1Q60670 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Sik1Q60670 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Sik1Q60670 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Sik1Q60670 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,53
Sik1Q60670 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Sik1Q60670 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30,82■■■□□ 2,52
Sik1Q60670 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Sik1Q60670 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Sik1Q60670 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Sik1Q60670 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Sik1Q60670 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Sik1Q60670 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30,8■■■□□ 2,52
Sik1Q60670 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Sik1Q60670 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Sik1Q60670 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Sik1Q60670 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Sik1Q60670 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Sik1Q60670 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms