Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec4a4Q5YIR8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec4a4Q5YIR8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clec4a4Q5YIR8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec4a4Q5YIR8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec4a4Q5YIR8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms