Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpa6Q5U901 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cpa6Q5U901 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpa6Q5U901 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpa6Q5U901 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpa6Q5U901 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpa6Q5U901 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpa6Q5U901 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpa6Q5U901 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpa6Q5U901 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpa6Q5U901 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpa6Q5U901 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpa6Q5U901 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpa6Q5U901 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpa6Q5U901 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpa6Q5U901 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms