Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bbs12Q5SUD9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bbs12Q5SUD9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bbs12Q5SUD9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bbs12Q5SUD9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bbs12Q5SUD9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bbs12Q5SUD9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms