Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sco1Q5SUC9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sco1Q5SUC9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sco1Q5SUC9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sco1Q5SUC9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sco1Q5SUC9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms