Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PkdccQ5RJI4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PkdccQ5RJI4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PkdccQ5RJI4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PkdccQ5RJI4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PkdccQ5RJI4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PkdccQ5RJI4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PkdccQ5RJI4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PkdccQ5RJI4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PkdccQ5RJI4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PkdccQ5RJI4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PkdccQ5RJI4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PkdccQ5RJI4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PkdccQ5RJI4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PkdccQ5RJI4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PkdccQ5RJI4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PkdccQ5RJI4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PkdccQ5RJI4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PkdccQ5RJI4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PkdccQ5RJI4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms