Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chsy3Q5DTK1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chsy3Q5DTK1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chsy3Q5DTK1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chsy3Q5DTK1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms