Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WhammQ571B6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WhammQ571B6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WhammQ571B6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
WhammQ571B6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WhammQ571B6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WhammQ571B6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WhammQ571B6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WhammQ571B6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WhammQ571B6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WhammQ571B6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WhammQ571B6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WhammQ571B6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms