Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Tmtc2Q56A06 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Tmtc2Q56A06 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Tmtc2Q56A06 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Tmtc2Q56A06 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Tmtc2Q56A06 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Tmtc2Q56A06 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Tmtc2Q56A06 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tmtc2Q56A06 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Tmtc2Q56A06 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tmtc2Q56A06 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Tmtc2Q56A06 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Tmtc2Q56A06 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tmtc2Q56A06 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Tmtc2Q56A06 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Tmtc2Q56A06 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Tmtc2Q56A06 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Tmtc2Q56A06 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Tmtc2Q56A06 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Tmtc2Q56A06 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Tmtc2Q56A06 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Tmtc2Q56A06 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27,27■■□□□ 1,96
Tmtc2Q56A06 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Tmtc2Q56A06 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Tmtc2Q56A06 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Tmtc2Q56A06 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Tmtc2Q56A06 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27,2■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27,2■■□□□ 1,95
Tmtc2Q56A06 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Tmtc2Q56A06 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Tmtc2Q56A06 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Tmtc2Q56A06 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Tmtc2Q56A06 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Tmtc2Q56A06 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Tmtc2Q56A06 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Tmtc2Q56A06 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Tmtc2Q56A06 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Tmtc2Q56A06 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Tmtc2Q56A06 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Tmtc2Q56A06 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Tmtc2Q56A06 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Tmtc2Q56A06 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Tmtc2Q56A06 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Tmtc2Q56A06 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Tmtc2Q56A06 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Tmtc2Q56A06 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Tmtc2Q56A06 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Tmtc2Q56A06 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Tmtc2Q56A06 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47,3 ms