Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prune2Q52KR3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prune2Q52KR3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prune2Q52KR3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prune2Q52KR3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prune2Q52KR3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prune2Q52KR3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prune2Q52KR3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prune2Q52KR3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prune2Q52KR3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prune2Q52KR3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms