Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Herc2Q4U2R1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Herc2Q4U2R1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Herc2Q4U2R1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Herc2Q4U2R1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Herc2Q4U2R1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc2Q4U2R1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc2Q4U2R1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Herc2Q4U2R1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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